Les thèses OMER​

Yoluène Massey

Les populations d’élasmobranches ont diminué de 70 % en 50 ans du fait de leur exploitation massive par la pêche. Dans le sud-ouest de l’océan indien, il existe un manque crucial de connaissances sur les pêcheries artisanales et leurs interactions avec les élasmobranches. En s’intéressant aux interactions entre écosystèmes et bien-être humain, les approches bioculturelles partent explicitement des connaissances locales et des croyances culturelles pour comprendre le fonctionnement d’un système. La thèse vise à interroger, comprendre et synthétiser la diversité des connaissances – les unes issues des savoirs locaux, les autres issues de la recherche académique sur les élasmobranches afin d’identifier des indicateurs bioculturels permettant d’envisager des perspectives de suivi et d’évaluation de leur exploitation à long terme et ainsi élaborer des mesures de conservation à une échelle locale, dans la région du Nord-Est du Canal du Mozambique.

Thèse encadrée par Johann Mourier (Université de Montpellier, MARBEC – UMR 248) et Catherine Sabinot (IRD, Espace-Dev – UMR 228)

En lien avec l’axe 4 et le GT EcOSEM.

Stefania Rosolen

Cette thèse examine comment les manuels scolaires français traitent des enjeux liés au changement climatique et à l’océan, en analysant le contenu scientifique, les activités pédagogiques, et leurs effets cognitifs, émotionnels et comportementaux sur élèves et enseignants. Malgré les avancées de la France en matière d’éducation au développement durable, des obstacles persistent, tels que le cloisonnement disciplinaire et le manque de formation des équipes éducatives, entravant une intégration complète et large de ces enjeux. À travers une analyse des manuels et des enquêtes auprès des enseignants, cette recherche vise à identifier les lacunes actuelles et à proposer des recommandations pour enrichir l’éducation climatique et à l’océan dans le système scolaire français.

Thèse encadrée par Eric Guilyardi (CNRS, LOCEAN – UMR 7159) et Benjamin Quesada (Université Del Rosario, Colombie).

En lien avec l’axe 1 et transverse à tous les GTs.

Ghjuvan Santoni-Guichard

Le micronecton est essentiel aux zones mésopélagiques océaniques. Leurs migrations nycthémérales (alimentation en surface la nuit et métabolisation en profondeur le jour), jouent un rôle clé dans la pompe à carbone biologique. L’acoustique active permet d’étudier ces migrations, mais des défis subsistent pour identifier précisément les espèces. Ce projet de thèse propose d’exploiter la composante fréquentielle des signaux acoustiques pour améliorer l’identification des organismes,
grâce à l’utilisation de profileurs acoustiques large bande, qui offrent une meilleure résolution et une analyse plus précise des cibles individuelles. Cette composante fréquentielle peut aussi être exploitée dans le domaine audible, via une approche novatrice de sonification, afin d’explorer d’autres possibilités face à la difficulté persistante d’identification des communautés. Les objectifs sont de quantifier les dynamiques verticales des migrations nycthémérales du micronecton et de classifier les cibles individuelles et d’étudier leurs dynamiques respectives.

Thèse encadrée par Frédéric Ménard (IRD, MIO – UMR 7294), Anne Lebourges-Dhaussy (IRD, LEMAR – UMR 6539) et Étienne Hendrickx (UBO, Lab-STICC – UMR 6285).

En lien avec les axes 1 et 2 et les GTs OA, NO3 et OPS.

Sébastien Gigot Leandri

La biodiversité et l’abondance des espèces se détériorent dans la plupart des écosystèmes mondiaux, mais peut-être nulle part aussi rapidement que sur les récifs coralliens qui procurent bien-être, revenus et sécurité alimentaire à plus d’un milliard de personnes dans le monde. Les aires marines protégées (AMP) peuvent constituer des moyens efficaces pour atténuer ces impacts en fonction de leurs caractéristiques mais de nombreux facteurs interfèrent avec leur efficacité. Nous manquons toujours de modèles prédictifs permettant de mieux estimer, comprendre et prédire la dynamique de la biodiversité et de la biomasse des poissons coralliens en fonction des facteurs socio-environnementaux opérant à différentes échelles. Les algorithmes de type Deep Learning, qui vont coupler l’imagerie satellite et l’information locale, seront testés pour améliorer la précision des modèles et comparer l’importance des facteurs à l’échelle globale.

Thèse encadrée par David Mouillot (Unversité de Montpellier, MARBEC – UMR 9091) et Alexis Joly (INRIA, LIRMM – UMR 5506).

En lien avec les axes 2, 3 et 4 et les GTs OceNum et NO3.

Sergio Cambronero Solano

Le projet Argo-Dome est une initiative scientifique visant à déployer un système d’observation de l’océan avec des flotteurs multi-instrumentés dans la région du Dôme Thermal, une zone cruciale de l’océan Pacifique oriental. Ces flotteurs recueilleront des données essentielles sur les conditions de l’océan pour améliorer notre compréhension des processus physico-biogéochimiques qui influencent le fonctionnement des écosystèmes marins. Nous aborderons quatre questions de recherche, chacune liée à une hypothèse. Nous analyserons les modes de variabilité spatio-temporelle du Dôme (Q1) et leur impact sur les services écosystémiques (Q2), étudierons les pressions écologiques et sociales (Q3) et développerons une planification de conservation tridimensionnelle (Q4) pour une gestion basée sur les écosystèmes, en accord avec la convention des Nations Unies Biodiversity Beyond National Jurisdiction (BBNJ), qui vise à protéger la biodiversité au-delà des juridictions nationales. Ces informations seront précieuses pour soutenir les efforts internationaux de conservation et gestion des océans et pour renforcer cet accord BBNJ.

Thèse encadrée par Vincent Taillandier et Hervé Claustre (CNRS, Laboratoire d’Océanographie de Villefranche – UMR 7093), et Joachim Claudet (CNRS, Centre de Recherches Insulaires et Observatoire de l’Environnement – UMR 3278).

En lien avec les axes 2 et 4, et les GTs O2P, NO3, OPS et GOM.

Arthur Jumaucourt

Les barrages de pêcherie comptent parmi les vestiges archéologiques les plus anciens bâtis sur l’estran. Ils témoignent des stratégies adoptées depuis la Préhistoire par les populations maritimes pour capturer le poisson. Cependant, la montée du niveau marin durant l’Holocène, c’est-à-dire depuis la dernière déglaciation, a englouti la plupart de ces structures. De ce point de vue, la Bretagne présente un patrimoine exceptionnel doté de barrages récents (visibles à marée basse) et plus anciens (aujourd’hui submergés, mais pas recouverts de sédiments). Faute de données chronologiques précises, le moment de construction de ces structures est très mal connu. Le projet PEPITO vise à obtenir des jalons temporels en mettant à profit le développement récent de la datation par luminescence de surfaces des roches. Ces données seront ensuite exploitées pour tester et affiner un modèle liant l’altimétrie (la profondeur actuelle) des barrages à leur ancienneté.

Thèse encadrée par Guillaume Guérin (CNRS, Géosciences Rennes – UMR 6118) et Daniel Le Bris (Université de Bretagne Occidentale, Centre de recherche bretonne et celtique – UAR 3554).

En lien avec les axes 1 et 2 et les GTs POETE, PHO, O2P et ELNM.

Elettra Figà Talamanca

C. flexa a été découverte dans des flaques sur la côte de Curaçao : ces choanoflagellés évoluent dans un environnement transient, alimenté par les vagues et soumis à l’évaporation, où elles sont menacées par de nombreux prédateurs. La transition à la multicellularité a de multiples bénéfices, comme se nourrir plus efficacement, mieux se défendre, diminuer le coût énergétique d’un déplacement. Quels sont les avantages de la multicellularité chez C. flexa ?
La thèse expérimentale s’organisera selon trois axes : tout d’abord, comment les colonies se forment-elles ? En particulier, nous modéliserons la force d’adhésion entre les cellules, qui ne secrètent pas de matrice extracellulaire pour maintenir la colonie. Ensuite, comment les colonies s’inversent-elles ? Nous étudierons la force fournie par une cellule lors de l’ouverture de sa collerette, et explorerons le rôle hydrodynamique des flagelles. Enfin, quelle est la dynamique d’inversion ? Nous quantifierons les facteurs environnementaux qui déclenchent l’inversion, et nous modéliserons la stabilité de la
configuration ‘active’ avant qu’elle ne relaxe. Ces résultats démontreront l’avantage évolutif de former des colonies.

Thèse encadrée par Juliette Pierre (CNRS, Institut d’Alembert – UMR 7190) et Hélène de Maleprade (Sorbonne Université, Institut d’Alembert – UMR 7190).

En lien avec les axes 1 et 2 et les GTs OA et TEAM.

Jessica Dos Santos

Le projet de thèse a pour objet l’étude de la connectivité des populations de poissons récifaux en Polynésie française. Il associe génétique des populations et géographie culturelle afin d’approfondir, d’une part, la compréhension des savoirs et représentations de la connectivité marine et, d’autre part, la finesse des estimations de la connectivité génétique d’espèces de poissons récifaux. Cela permettra de fournir des éclairages significatifs sur la dynamique complexe de la connectivité marine et ainsi aider les politiques à mettre en place un dispositif de préservation de cette connectivité qui soit à la fois solide sur le plan scientifique, mais aussi socio-culturellement adéquat. Pour cela, des analyses moléculaires seront réalisées à partir d’échantillons obtenus à 24 ans d’intervalle pour estimer la connectivité marine et ses variations potentielles. Des enquêtes de terrain seront également menées pour recueillir les représentations des habitants sur la connectivité marine et son fonctionnement.

Thèse encadrée par Cécile Fauvelot (IRD, ENTROPIE – UMR 9220) et Teriitutea Quesnot (Université de Bretagne Occidentale).

En lien avec les axes 1 et 2 les GTs O2P, O-Connect et GOM.